Systeembiologie

Planten ontwikkelen die bestand zijn tegen droogte, die kunnen groeien op zoute grond of die toe kunnen met minder fosfaat. Daar werken systeembiologen van Plant Research International aan. Ze brengen daarbij alle niveaus van de plant met elkaar in verband, van het genen-niveau tot aan de plant in zijn omgeving. Zo ontstaat begrip voor welke processen op de verschillende niveaus spelen en hoe die processen aan elkaar gekoppeld zijn.

- De social media buttons kunnen niet getoond worden - controleer uw instellingen

Echt goed begrip van de groei van de plant vereist intensieve samenwerking tussen onderzoekers die op verschillende niveaus bezig zijn. Het betekent ook een voortdurende 'modelleercyclus'. Biologen en chemici rafelen in het lab of op het veld uiteen welke onderdelen betrokken zijn bij een bepaald proces. Ze zoeken naar genen, eiwitten en stofwisselingsproducten. Ze kijken wat er gebeurt op het niveau van de cel, het orgaan of het hele ecosysteem en verzamelen grote hoeveelheden gegevens.

Modelleren

Bio-informatici brengen de gegevens uit die ‘plant’-fase met elkaar in verband en maken er een mathematisch model mee, waarmee ze de processen zo precies mogelijk proberen te beschrijven. Blijkt het model de werkelijkheid niet goed genoeg te beschrijven, dan volgt opnieuw een plantfase en een nieuwe modelleerfase. Net zolang tot het model de werkelijkheid goed genoeg voorspelt. Zo ontstaat uiteindelijk een voorspellend model, opgebouwd uit wiskundige vergelijkingen, die de processen in de levende plant beschrijven. Daarmee wordt het mogelijk bepaalde processen zo te veranderen dat er een plant uit tevoorschijn komt die bijvoorbeeld goed groeit met weinig water.

Modelleren

Voorbeelden van Systeembiologie onderzoek